Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms