Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf16Q9BUW7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf16Q9BUW7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms