Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF496Q96IT1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF496Q96IT1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF496Q96IT1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF496Q96IT1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF496Q96IT1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF496Q96IT1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms