Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BCANQ96GW7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCANQ96GW7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCANQ96GW7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCANQ96GW7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCANQ96GW7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms