Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTROBQ8N137 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTROBQ8N137 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms