Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
WDR53Q7Z5U6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
WDR53Q7Z5U6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms