Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC9Q6ZRR7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms