Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SYNE3Q6ZMZ3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNE3Q6ZMZ3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms