Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms