Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TXNRD1Q16881 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms