Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME3Q16798 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME3Q16798 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME3Q16798 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME3Q16798 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME3Q16798 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME3Q16798 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME3Q16798 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME3Q16798 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME3Q16798 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME3Q16798 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME3Q16798 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME3Q16798 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME3Q16798 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME3Q16798 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME3Q16798 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME3Q16798 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ME3Q16798 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ME3Q16798 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ME3Q16798 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ME3Q16798 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ME3Q16798 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ME3Q16798 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ME3Q16798 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ME3Q16798 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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