Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LAMA3Q16787 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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