Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NTRK2Q16620 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NTRK2Q16620 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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