Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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