Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIP13Q15645 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms