Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIP10Q15642 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP10Q15642 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms