Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PRKD1Q15139 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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PRKD1Q15139 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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PRKD1Q15139 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PRKD1Q15139 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PRKD1Q15139 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PRKD1Q15139 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PRKD1Q15139 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PRKD1Q15139 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PRKD1Q15139 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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