Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms