Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DSC3Q14574 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms