Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MKRN4PQ13434 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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