Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms