Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN7AQ01118 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN7AQ01118 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms