Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
E2F1Q01094 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
E2F1Q01094 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms