Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH15P55291 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH15P55291 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDH15P55291 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDH15P55291 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH15P55291 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH15P55291 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH15P55291 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH15P55291 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH15P55291 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH15P55291 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms