Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASP6P55212 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CASP6P55212 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CASP6P55212 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP6P55212 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP6P55212 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP6P55212 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP6P55212 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP6P55212 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CASP6P55212 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP6P55212 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP6P55212 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP6P55212 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP6P55212 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP6P55212 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP6P55212 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP6P55212 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP6P55212 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP6P55212 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP6P55212 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP6P55212 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP6P55212 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP6P55212 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP6P55212 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CASP6P55212 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms