Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AFDNP55196 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AFDNP55196 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFDNP55196 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFDNP55196 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFDNP55196 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFDNP55196 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFDNP55196 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFDNP55196 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFDNP55196 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFDNP55196 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFDNP55196 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFDNP55196 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AFDNP55196 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFDNP55196 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFDNP55196 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AFDNP55196 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AFDNP55196 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFDNP55196 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFDNP55196 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFDNP55196 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFDNP55196 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFDNP55196 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFDNP55196 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFDNP55196 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFDNP55196 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AFDNP55196 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFDNP55196 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFDNP55196 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFDNP55196 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFDNP55196 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFDNP55196 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFDNP55196 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AFDNP55196 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms