Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EFNA4P52798 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms