Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RORCP51449 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RORCP51449 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RORCP51449 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORCP51449 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms