Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RANGAP1P46060 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RANGAP1P46060 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms