Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASQ1P31415 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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CASQ1P31415 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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CASQ1P31415 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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CASQ1P31415 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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CASQ1P31415 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASQ1P31415 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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