Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA10P31260 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms