Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP1P29466 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP1P29466 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP1P29466 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP1P29466 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP1P29466 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP1P29466 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP1P29466 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP1P29466 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP1P29466 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP1P29466 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms