Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLD1P28340 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD1P28340 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD1P28340 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD1P28340 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD1P28340 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD1P28340 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD1P28340 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD1P28340 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD1P28340 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD1P28340 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD1P28340 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLD1P28340 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLD1P28340 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD1P28340 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD1P28340 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD1P28340 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD1P28340 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD1P28340 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD1P28340 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD1P28340 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD1P28340 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD1P28340 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD1P28340 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD1P28340 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD1P28340 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD1P28340 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLD1P28340 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLD1P28340 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLD1P28340 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLD1P28340 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLD1P28340 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLD1P28340 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLD1P28340 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLD1P28340 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLD1P28340 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLD1P28340 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLD1P28340 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLD1P28340 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLD1P28340 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLD1P28340 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLD1P28340 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLD1P28340 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLD1P28340 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLD1P28340 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLD1P28340 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLD1P28340 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLD1P28340 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLD1P28340 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLD1P28340 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLD1P28340 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLD1P28340 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLD1P28340 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLD1P28340 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLD1P28340 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLD1P28340 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLD1P28340 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLD1P28340 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLD1P28340 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLD1P28340 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLD1P28340 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLD1P28340 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms