Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCO2O43819 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCO2O43819 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCO2O43819 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCO2O43819 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SCO2O43819 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCO2O43819 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCO2O43819 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCO2O43819 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCO2O43819 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCO2O43819 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCO2O43819 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCO2O43819 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCO2O43819 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCO2O43819 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCO2O43819 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCO2O43819 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCO2O43819 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCO2O43819 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCO2O43819 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCO2O43819 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCO2O43819 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCO2O43819 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCO2O43819 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCO2O43819 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCO2O43819 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms