Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf170A2RU37 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms