Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPC1L1Q9UHC9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms