Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMILIN3Q9NT22 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms