Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SNX15Q9NRS6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SNX15Q9NRS6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms