Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDGFDQ9GZP0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDGFDQ9GZP0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms