Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZC3H12CQ9C0D7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZC3H12CQ9C0D7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ZC3H12CQ9C0D7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZC3H12CQ9C0D7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZC3H12CQ9C0D7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZC3H12CQ9C0D7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms