Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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