Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC246787.1-201ENST00000392301 627 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004918.1-201ENST00000467537 770 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC137794.1-201ENST00000509185 914 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC084759.2-202ENST00000557976 1053 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF148-201ENST00000434824 1304 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP41-203ENST00000343969 1087 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPIL3-202ENST00000392283 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 PQLC2L-206ENST00000468043 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005597.1-201ENST00000534192 802 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms