Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR2Q9BYE9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDHR2Q9BYE9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms