Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TDRD1Q9BXT4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD1Q9BXT4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD1Q9BXT4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD1Q9BXT4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD1Q9BXT4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD1Q9BXT4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD1Q9BXT4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDRD1Q9BXT4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms