Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAM1Q96QH2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms