Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SAMD8Q96LT4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SAMD8Q96LT4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SAMD8Q96LT4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SAMD8Q96LT4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SAMD8Q96LT4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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