Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BORCS6Q96GS4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BORCS6Q96GS4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms