Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LTV1Q96GA3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms