Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX54Q8TDD1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms