Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP47Q6ZTR5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms